《南京的那个夏天》从老百姓的视角讲述了南京人民对美好生活的执着与热爱。有着十五年安全驾驶记录的普通大巴司机贺南京，因与妻子卫莉婚后长期不孕，面临来自各方面的压力，两人的感情和婚姻遭遇危机。在卫莉离开贺南京的那段日子里，贺南京偶然邂逅单亲男孩童童。在照顾童童并与他一起生活的日子里，贺南京、卫莉相继重新领悟并找回了爱情与生活的真谛。
谷平安独自护送人镖小倩去找夫家，却在半途中被以刀疤脸为首的一伙绑匪绑架。王兆兴预感情况不妙，前去营救，竟遇到了曾经在飞鱼营干过的师兄游四。王兆兴向游四打听刀疤脸的消息，不料游四竟向王兆兴隐瞒实情，还指路为马。经过一番调查，以及小师妹保护朝廷刘大人调查官粮囤积案所掌握的信息，众人终于闯入最阔祸首黄布政大人的行宫。在大量证据面前，黄布政和游四的丑恶行径和贪赃枉法不攻自破，刘大人将贪官缉拿归案，游四趁机溜走。王兆兴追出野外，与昔日的师兄展开一番较量，游四终有所顿悟，倔强的他却结束了自己的性命，王兆兴不免感到伤感和惋惜。
一名年轻重犯被送到监狱服刑，却在女惩教员内心投下巨型情绪炸弹。素来理想主义、对监犯仁慈的她，申请调到重犯监禁区，逐步亲近她的猎物，争取他的信任，致力安排他与母亲见面。是母性大发，要拯救这头狂野之狼，抑或被勾起了掩藏多年的暗黑过去，一发不可收拾？毕竟，监狱令人疯狂，不！疯狂与监狱，都只是规训张狂的病征，真相在扭曲力量下根本毫无位置。到头来伦理悬疑、恩怨情仇，可都是存在反思的药引？在呕吐之前，等待偿还的也许太多。
