动画第2季《Fatekaleid liner》（魔法少女伊莉雅2wei）将是漫画版《Fatekaleid liner魔法少女伊莉雅2wei》的内容，紧接第一季，继续讲述自回收卡片作战过后数周以来，伊莉雅重返过去的日常生活。然而，既然已经当过魔法少女，麻烦就会如影随形！这次她竟然是被无预警出现的另一个自己追杀!魔法恐怖(？)故事。第2幕堂堂开演！
动画以被神秘的外星人德拉克特毁灭了几乎所有人类的地球为舞台展开。过去人类为了躲避外星人而藏身的避难所伊克西亚，毁灭之日的记忆被抹去的居民们什么都不知道地过着普通的生活。但是住民中也有一部分的“被选中的人”们，驾驶着名为罗格的巨大机器人与外星人战斗着……
东方院行人（下野紘 配音）是一个不太擅长和女孩子打交道的害羞少年，在一次负气出走中，倒霉的行人竟然遇见了百年难得一见的超级暴风雨。顺着海浪，行人漂流到了一座叫做蓝岛的岛屿上，而这竟然是一个全部都是女孩子的圣地！从来没有见过男孩子的女孩们对行人的到来产生了莫大的兴趣，为了避免混乱发生，岛上的长老决定举行一个“夫婿捉鬼游戏大会”，对于行人来说，他要做的唯一事情即是拼命逃跑。 在岛上，行人结识了傻萌的小铃（堀江由衣 配音），能干的铃音（千叶纱子 配音），巫女麻知（高桥美佳子 配音）以及一大帮善良有爱的朋友们，蓝岛快乐又惊险的生活开始了！
