《狐妖小红娘》的故事围绕人与妖之间的爱情展开。根据古典小说记载，世上有人有妖，妖会与人相恋，妖寿命千万年，人的寿命有限，人死了，妖活着。人会投胎转世，但投胎以后，不记得上辈子的爱。妖如果痴情的话，就去找狐妖“购买”一项服务，让投胎转世的人，回忆起前世的爱。狐妖红娘这一个角色就这样诞生，作品主要讲述了以红娘为职业的狐妖在为前世恋人牵红线过程当中发生的一系列有趣、神秘的故事。
故事讲述了人们从出生开始，就被付与了一本书。从生到死按照“命运之书”记载的脚本生存下去的宿命。在此之中，持有空白脚本的“空白之书”出生的艾克斯，与同样拥有“空白之书”的同伴们相遇，踏上了寻找自己使命的旅程。这是一部被不断阅读过的童话故事。
少年×少女×付丧神。 经过漫长岁月的器物，最终其有了“心”，即为付丧神的诞生。 因付丧神将重要的人夺走，因而憎恨著期的青年·岐兵马。 与六名付丧神同住，像“家人”般爱着他们的少女·长月牡丹。 于千年之都的京都，两人相遇了，并一起同住。 在前途多难的屋檐下，三者展开了交错的共同生活。 人与物。羁绊与恋情的付丧神物语。
2020年。 人类从平流层下降 被怪异的生命体·怪异所威胁。 为了讨伐怪异而组织起来的是怪伐军。 那个将脑内的视觉系统具体化 拥有“超脑力”的人的集团。 完成入伍的Yite和kazane 被卷入无法抗拒的命运和世界的真相
