以阿鲁鲁为首的始源星族，自称是奇轮星和奇轮战士的主人，奇轮王烈焰被擒获，并被强行给予神兽轮，变成只懂破坏的工具。失控烈焰在地球大肆破坏，但在小萨儿子小吉爱的呼唤下恢复清醒，并吸收神兽轮的力量，升级为全新形态。此时小萨因调查事件真相，将烈焰交托给小吉后独自离开。小吉、烈焰为了拯救奇轮星，参加地球奇轮选拔赛。
1910年代，由大日本帝国陆军设立的学校——陆军栖凤中学。这是一个为获取可用于军事的超常力量而收集、研究超自然现象的特殊机构。栖凤中学三年级学生岩元胡堂奉军部指令，奔赴全国各地进行调查。然而他所到之处。
