该剧根据真实的历史事件编写而成，反映了雾都解放前夕，国民党准备在撤离大陆之前炸毁雾都的兵工厂和重要基础设施，表现了国共两党的殊死较量和尖峰对决。剧作通过三大家族在风云激荡的乱世之秋中的兴衰沉浮以及方梦凯、罗丹和董海妹之间奇特的情感际遇和命运描写，演绎出剧中主人公面对强敌以及敌人的罪恶阴谋，同仇敌忾，决死抗争，慷慨赴死，不惜抛头颅洒热血的崇高爱国主义精神。
千金小姐君青蓝惨遭家族抄家灭门，昔日未婚夫李从尧非但未施以援手，还亲手毁掉她的容貌。她死里逃生，改头换面，女扮男装化身大理寺仵作，隐忍蛰伏一心翻案复仇。却不想与李从尧再相遇，昔日挚爱已然变成冷血狠戾的端王，还强行将她掳来肆意囚禁。爱恨纠缠，权谋诡谲接踵而至，旧案疑云层层浮现，一场复仇与情愫之间的博弈再次展开。
七年前，云州太守府一夜灭门，七十三口人凭空消失，现场只留七道血指印。七年后，刑案司主簿沈墨在义庄七口空棺中，发现一枚内藏血丝的诡异玉髓。他以为自己在追查一桩盗尸案，却发现自己早已是别人棋盘上的棋子。 所有灵异皆是人为。但人为的背后，藏着一个延续百年的惊天阴谋——有人以“九转轮回阵”窃取国运、逆转生死，而启动阵法的最后一把钥匙，竟是沈墨的血。 他追查父亲失踪的真相，却发现父亲七年前并非失踪，而是以身入局。当他终于踏入那座九层黑塔，坐在塔顶等待他的人——那个人的身份，足以颠覆他所有的认知。 他是谁？是救赎，还是更大的陷阱？ 当至亲成为最大的谜题，当真相需要用命去换——你，还敢往下查吗？ 《皇城诡案》，异象必人为，诡案有真相。
清末民初，佛山武学宗师黄飞鸿因噩梦预感女记者莫十三遇险，携弟子前往古云村寻人。村中蜈蚣教借蛊术胁迫村民献祭孩童，莫十三探查真相时被擒，身中噬魂蛊。黄飞鸿闯祭坛救人，因不忍伤及被蛊惑的村民反中蛊毒，幸得卧底蜈蚣教的鬼脚七暗中相助。众人合力破除水源蛊毒，救治村民，鬼脚七伤愈拜师。巫师自焚后，线索指向广州东瀛会馆。黄飞鸿潜入会馆救出被掳孩童，对决主事服部一郎，得知幕后黑手为西洋吸血鬼麦克罗。麦克罗散播疫毒祸乱羊城，以莫十三性命相要挟。黄飞鸿于绝境中融合腿法，悟出佛山无影脚，击杀麦克罗。蛊毒尽解，百姓恢复神智，广州重归太平，宝芝林重回烟火日常。
