四大宗门之首的玄灵宗，多年来第一次来临水城选拔弟子，方秦两家围绕这一个将决定二者命运的契机，展开明争暗斗。最终，秦南依靠潜心修炼、绝佳天资以及奇遇所得的战神之魂，在使者萧轻雪的公正判罚下，成功扭转颓势战胜方家。进入宗门后，秦南因卷入萧轻雪被逼婚一事，惹来宗主之子欧阳君的仇视。为了不断变强，报答萧轻雪的知遇之恩，秦南屡破强敌，连夺万象大比、外门大比第一、与四大宗门天才共闯武缘阁，并获得搅动大陆的惊天秘密，与冷锋约战生死殿、破北海家围困临水城之难，探索九字真言塔，誓与宗门恶势力战斗到底。
算命为生的梁夕因一时善心救下仙人宇文青阳，被仙人传授万年真力和翻天印，从此踏上了修真之路。在宇文青阳的指示下，梁夕前往天灵门拜师学艺。而路途中，梁夕遇到了莫名亲切而一起同行的小白狐。 以天灵门作为修行起点的梁夕结识了朋友与师尊，又阴差阳错从妖兽身上获得了神秘兵器坎水刃。坎水刃乃是云麓仙居开山祖师的法宝武器，他们要求梁夕归还，但如果梁夕能让龙息淬炼坎水刃的话他们就不予追究，否则就要天灵门付出代价。看出云麓仙居是借故找茬的梁夕决心前往东海寻找龙族，却因为意外吸入龙族血液，成为了天地间第一位龙族外戚。在向龙神说明情况之后，梁夕达成了龙神提出的要求，成功让坎水刃被龙息淬炼，也救回了师门。 云麓仙居的出现不过是插曲，正值天灵门掌教青木道人突破金仙出关时，天灵门上空突然出现了空间裂缝，从中出现的双头老祖带着人面蜘蛛大举进攻，一度将梁夕掳到了人界之外，生命危机之时...
三年前，云岚宗少宗主纳兰嫣然贸然退婚，倍感耻辱的萧炎遂与纳兰嫣然定下三年之约。为了这个约定，萧炎一直修炼不息，从魔兽山脉到塔戈尔沙漠的历练，从炼丹到吞噬异火的焚身之痛，都为证明那句话：“三十年河东，三十年河西，莫欺少年穷”。如今，萧家男儿必将迎难而上，永不退缩，萧炎的成长之路仍在继续……
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网络动画《秦时明月之沧海横流》是由沈乐平执导、杭州玄机科技信息技术有限公司出品的中国3D武侠动画《秦时明月》系列（故事背景取自秦始皇统一六国到咸阳城被攻陷这段英雄辈出的历史时期，是一部以武侠为主题的全民型动漫）的第六部作品。
