1945年，艰苦卓绝的抗日战争取得伟大胜利，中国在和平与战争、光明与黑暗等重大问题上，面临艰难抉择。以毛泽东、周恩来、朱德、刘少奇为首的中国共产党人，以人民为中心，与以蒋介石为首的国民党独裁者展开大决战。毛泽东以大无畏气概，孤身涉险赴重庆谈判，指挥解放军抢占东北、转战陕北、发起三大战役、进行土地革命，发布“五一口号”。中国共产党的政策，赢得广大人民群众和民主党派的欢迎拥护，最终战胜了蒋介石王朝。1949年10月1日，中华人民共和国宣告成立。
海峡指挥塔被撞，颜子洲（夜刃）受命展开调查，此时妹妹小小忽然坠楼！颜子洲设下三十六计，带二弟宗小权和小小失散的双胞胎姐姐黎璃，协助当地警署通过黎洛揭露十八年前双亲被害案，将首恶何欢姐弟、康庆田等人绳之于法。
1946年至1949年，中共武汉地下党曾惇刘实等人分别以职员工人等身份潜入武汉，在白色恐怖氛围下，他们和其他潜伏人员并肩作战，与国民党反动派进行隐蔽斗争。与此同时，一支来自现代的真探小队也走进了历史现场。
1994年，春江市税务局稽查员欧阳旭（井柏然饰）与刑警严平安（孙艺洲饰）、寻妻的周海洋（张颂文饰）三人因一起假发票案识于微时，携手屡破税案，但时代的发展和遭遇的不同，将三人推向不同的命运，三人也因各自的性格和追求作出了不同的选择，最终渐行渐远，由正邪的立场发展出迥异的命运轨迹。而今，他们的命运又因“谷雨”行动再次交汇，曾经的兄弟成为了如今的对手，在情与理之间，欧阳旭与以周海洋为首的骗税团伙以及深不见底的“保护伞”展开层层较量，由一张张小小发票，揭开贪婪私欲，最终以一场稽查风暴荡涤污秽，让正义重构社会清明。
