该剧主要讲述了省城千金初七（徐樱洛饰）为寻找失踪的姐姐十三（谌玮琦饰）而无意间被牵扯进了离奇命案，负责案件的警官吴旭（徐浩翔饰）因怀疑初七是凶手而一路穷追不舍。一切矛头指向了神秘又诡异的小镇凤鸣村，前来找寻十三的初七假冒吴旭警官身份目睹了一件件惊人案件，就在危险逐渐靠近之际，及时赶到的吴旭与青梅竹马谷雨生（雷澍饰）发现了凤鸣村背后隐藏的秘密，十三的失踪、接连的凶杀案都和凤鸣村村长贾全（梁靖晨饰）与十三的未婚夫决明（罗一心饰）有着千丝万缕的关系......
“声名狼藉”的侯府世子李书白逃婚遇到意外，回府后发现新娘江玉箫对自己暗藏杀机，于是假装失忆与其周旋，意外发现新娘还有神秘身份，于是带着双重身份的夫妻二人暗中较量，又互相吸引， 最终收获双向奔赴的爱情。
1946年至1949年，中共武汉地下党曾惇刘实等人分别以职员工人等身份潜入武汉，在白色恐怖氛围下，他们和其他潜伏人员并肩作战，与国民党反动派进行隐蔽斗争。与此同时，一支来自现代的真探小队也走进了历史现场。
民国十二年，十万大山坠崖幸存的少年陈十三，为寻爷爷陈忠林，复仇东瀛阴阳师，潜伏兖州聚宝楼。他以一身天玄秘术揭穿骗局，破局除煞，意外撞破东瀛势力以七煞聚阴阵窃取华夏地脉，妄图召唤邪灵天照降世的惊天阴谋。陈十三联合军阀楚云飞，沈清秋等人，拔阵眼，破结界，救百姓，战阴阳师，持斩龙剑，携天师印，以华夏道术守护家国山河，终破东瀛灭华大计。
在异工大陆，偃师之术分护生营造的阳术与以器代人，截取生机的阴术。十年前阳术传人玄尘失踪，弟子陈青和经营木作坊，因处理门尺煞发现师父封印，踏上寻师之路。他与学者苏晚，唐小棠，老周等伙伴辗转各地破解煞局，发现怪事皆与迅速崛起的墨氏营造世家有关。墨家借建筑，地脉与厌胜机关抽取生机气运，欲集齐阴阳秘术实现阴阳合一。他一边集齐师父所留八卦铜钱破局，一边揭开玄尘与墨问山的旧怨及墨家老祖墨无痕血祭续命之秘。最终众人破大阵救出玄尘，以八卦盘逆转阴阳，摧毁墨无痕寄生数百年的根基，生机重归大地。最后四人整理机关图样与偃师经验，编成新的鲁班经匠家镜，完成从争夺秘术到重新定义技艺意义的转变。
