从一个灵气枯竭的末法时代，来到了武道昌盛的世界，诡异死亡的灵种，危机四伏的局面，让处于深渊的王昊何去何从？
《星学院Ⅲ之潘朵拉秘境》是“星学院”系列的第三部，主要讲述了菲洛、小月、美星三位魔法少女进入潘朵拉奇幻社就职的故事：菲洛和伙伴们通过在星学院的学习，成长为优秀的魔法师，并且即将面临毕业考核。然而这时，她们意外被卷入一场魔卡精灵的失踪事件。与此同时，瑞拉国王突然病重、潘朵拉魔卡风靡一时、王国大臣神秘消失，一切事件的背后似乎埋藏着十年前的一个惊天秘密。为了查明真相，菲洛和伙伴们加入潘朵拉奇幻社，成为极光组的一员。
古争锋本是守护神龙星的神龙，在上古与外星敌人的战斗中身受重伤故陷入了长久的沉睡。时光荏苒，再度苏醒的古争锋发现神龙星早已物是人非，而昔日受人敬仰的神龙也成了人们口中的恶龙，为了调查真相，也为了取回藏在龙王学院的宝藏，古争锋化为人形以导师的身份进入龙王学院，却阴差阳错地成为屠龙系的老师，为此古争锋一面悉心教授学员，一面努力找寻宝藏，几番调查下，古争锋发现龙王宝藏的知情人皆已离世，眼下唯一的线索可能在副院长夜江雪的手中。在接近夜江雪的过程中，古争锋多次出手协助，让夜江雪沉寂已久的内心泛起一丝涟漪，而与此同时，古争锋也被一股神秘力量盯上，躲避了多次暗杀行动后，古争锋感觉旧时的威胁正在逐步逼近，而找寻宝藏恢复力量，锻炼学员组成新的神龙军团抗击敌人迫在眉睫……
秦灭汉起，百废待兴。诸子隐世，氏族势行。驱车逐鹿，弱肉何争？同心携力，主臣兼行。天命赐异，源于甘星，施于阴阳，异于静动。静者天行，缓而止争；动者袍泽，速若雷霆。捕星之计，谋策之心。甘星入世，衍造异人。奸者祸国，忠者祸身，道貌离合，莫再成臣。离经叛道，天下重分。采薇采薇，复始如周，采薇采薇，复始若秦。
当游戏策划江城突然被拉进自己精心打造的数字世界时，他原本以为能在这片熟悉的地方游刃有余。然而，令他震惊的是，游戏中强大无比的魔王苏夜不知为何竟然觉醒了自我意识。苏夜不把江城当成主人，而是当成一个残忍创造了自己、随后又将自己抛弃在命定暴力生活中的神。为了逃回现实世界，江城被迫与苏夜结盟，踏上了一连串充满险阻的隐藏任务。然而，当现实与模拟之间的边界彻底消融时，真正的真相才浮出水面。江城发现自己的存在也不过是另一层复杂的代码，他意识到在一个庞大且层层叠叠的系统之中，他和苏夜是平等的。他们能否共同找到彼此存在的真正意义？
