不死少年陆沉身陷混沌域绝地百万年，只能依托庞大魂力以神识游历诸天万界，但每次游历之后都会陷入长久的沉睡中。历经无数年的暗中布局，改变命数轮回，终于在又一次苏醒后，于神魔墓园脱困而出，如龙入海。时过境迁，昔日被迫收下的徒弟竟成了修为通天的大帝，好心收养的小女孩已成为镇压一界的仙子，就连随手捡的一只癞皮狗，也已成为一宗之祖。诸天万界，天地为局，众生为子，对抗十二苍天，一切都在他谋划百万载的旷世奇局之中！
在这一季里，超级飞侠们都升级成为了愿望守护者 。 在新的一季中，超级飞侠们将摇身一变成为勇敢的愿望守护者，他们不仅拥有酷炫的新装备，同时每个超级飞侠都拥有不同属性的能量球。 在遇到困难需要帮助时，呼叫愿望守护者，启动愿望守护者程序，超级飞侠会带着不同的能量球，启动能量球，加入愿望守护，共同解决面临的阻碍与困难。 愿望能量球可以给超级飞侠和孩子们相同的强大力量去武装来完成伟大的事情，每个愿望能量球蕴含来自于我们身边的自然世界中不同的超强能量，它们是旋风、水波、大地、钢铁、动物、闪电、火焰等能量。 愿望守护者的任务是为小朋友们排忧解难帮助小朋友们实现他们的美好愿望。
现实中一切极端的梦境，都凝聚着可怕的能量。唯有将这些梦境送入异次元世界——梦界化消，才能避免这些能量对现实世界造成扭曲动荡。个性跳脱的任小冲，因巧合被来自梦界的渡梦使选中，成为笛见塔的化梦武士，展开了奇异的化梦之旅。在他与同伴武伽矛盾加剧的同时，另一座墨决塔悄悄展开了对笛见塔的侵略阴谋，并牵扯出梦界沉睡已久的秘密传说……
在本季《超级飞侠12》中，超级飞侠依然会接收来自世界各地小朋友的电话，为小朋友定制他们需要的特别的东西，并将东西送到他们手上。当小朋友们遇到困难，乐迪会请求总部的帮助，超级飞侠将带来拥有各种属性的愿望能量球，和小朋友们一起摇身一变成为酷炫的愿望守护者，陪同小朋友一起解决问题。而上一季新登场的三位超级飞侠新成员：恐龙飞机超级飞侠大壮、速食卡车超级飞侠糯糯、高速火车超级飞侠咚咚，也会在这一季中展示他们的过人之处。而当困难升级，超级基地也会变成超级机器人，跟超级飞侠一起陪小朋友们度过难关。
普通的应届大学毕业生夏铃在求职之际，收到了一条奇怪的面试通知，因此误入罗刹街并遭到了危险，幸而被镇魂将曹焱兵搭救。然而接触中，曹焱兵却发现夏铃并非看起来那样普通，因为她的身体里也存在着灵力，并且寄宿着一位神秘的守护灵。与此同时，夏铃开始遭到不明身份刺客的追杀，曹焱兵亦被卷入其中，二人的命运从此开始了交集，而在这一切的背后，似乎还隐藏着某些更加危险的秘密……
