随着和平的到来而走向近代化的木叶忍者村。高楼林立，巨大显示屏中播放出影像，连结各区域的电车在村里奔驰。虽说是忍者村，但一般民众也增多，忍者的生存方式也在逐渐改变的这个时代—— 村子的领袖，第七代火影·漩涡鸣人的儿子慕留人，进入了培育忍者的学校“忍者学校”。周围的学生们带着“火影的儿子”这样偏见的目光看待慕留人，但慕留人凭借天生的破天荒性格将这种小事轻松越过！ 慕留人与新的伙伴相遇，他将如何挑战突然发生的神秘事件？ 在众人心中如疾风般狂奔的“漩涡慕留人”的物语，现在开始！！
一位平凡的青年，在一场可怕的交通事故中丧生，误打误撞下竟然转生来到了异世界里，并被一位自称是贤者的法师梅林（屋良有作 配音）给捡回了家，梅林给这个孤零零的孩子取名为西恩（小林裕介 配音），开始教授他使用魔法。 一晃眼15年过去了，西恩从一个嗷嗷待哺的婴儿成长为了有为青年，名师出高徒，在师父严厉的教导之下，西恩已经拥有了非常强大的力量。当西恩决定进入亚尔斯海特高等魔法学院继续深造之时，梅林才发现，这么多年来，他一直只教西恩魔法，竟然忘记了规训他的常识，这也就意味着，西恩即将在对常识一窍不通的情况下进入学校和同龄人们开始集体生活。
那天，隶属于历战冒险者派对的尼克，被像父亲一样仰慕的队长宣告流放。为了那些散漫的伙伴们，尽管他们在账目和知识等方面支持着他们，但还是被冤枉为贪污。 被恋人甩了，完全堕落的尼克，偶然和在酒馆里成为了同桌的原贵族千金、破门神官、女龙战士情投意合。
——虽然很突然，但世界已经灭亡了。 1000年前一度毁灭的地球，由名为“Y”的传说中的时钟技师以时钟装置再构筑而成的世界。 吊车尾高中生·见浦直人，与“Y”所留下的自动人偶琉珠，以及天才时钟技师少女·玛丽相遇了。 当他们的能力相互咬合时，命运的齿轮开始转动。 不断重复破裂与延命，将即将崩坏的地球（“时钟机关之星”）修复的时钟朋克·幻想剧！
