随着和平的到来而走向近代化的木叶忍者村。高楼林立，巨大显示屏中播放出影像，连结各区域的电车在村里奔驰。虽说是忍者村，但一般民众也增多，忍者的生存方式也在逐渐改变的这个时代—— 村子的领袖，第七代火影·漩涡鸣人的儿子慕留人，进入了培育忍者的学校“忍者学校”。周围的学生们带着“火影的儿子”这样偏见的目光看待慕留人，但慕留人凭借天生的破天荒性格将这种小事轻松越过！ 慕留人与新的伙伴相遇，他将如何挑战突然发生的神秘事件？ 在众人心中如疾风般狂奔的“漩涡慕留人”的物语，现在开始！！
星野宫子（上田丽奈 配音）表面看来只是一个非常平凡的女大学生，实际上却拥有社交障碍，无法和人正常的交往，因此常常宅在家中，孤独的制作着华丽的Cosplay服装。星野日向（长江里加 配音）是宫子的妹妹，和姐姐阴郁的性格不同，日向非常的开朗健谈，而且深深的爱戴着姐姐。 一天，日向将自己在学校的好朋友白咲花（指出球亚 配音）带到家中做客，宫子在见到小花的一瞬间，竟然深深的被她给迷住了。但是宫子的个性令她无法坦率的和小花交朋友，为了成为能够配得上小花的人，宫子开始了努力。随着时间的推移，宫子和小花之间的距离渐渐拉近。
神赐之门“Divine Gate”打开后，常界、天界和魔界3个世界出现交集，带来了交织着欲望和战争的混沌时代。为了令世界恢复和平，一个名为“世界评议会”的组织结成了。而当世界恢复和平后，这个组织就变成了一个都市传说，直到名为“适合者”的少年少女们再次集结，开始探索神赐之门……
