小新今年5岁了，不要以为他是那种懵懂无知的小孩，他其实人小鬼大，喜欢漂亮的姐姐，收养了一条棉花糖一样的流浪狗——小白，还经常讲些无厘头的黄色笑话。小新的妈妈美伢是一个全职主妇，粗心而又有点神经质的她经常被小新捉弄得七窍生烟，爸爸野原亦经常被这两母子搞得晕头转向。 《蜡笔小新》的作者以一个5岁小童的眼光，40岁的成年人的心态去观察这个大千世界，看到了许多光怪陆离的景象，小新一家的幽默故事亦由此产生。
故事发生在云集着优雅大小姐的私立贵族学校藤崎女子中学，人称“野性的丽人”的仓桥莉子（沼仓爱美 配音）有着男孩子般狂野以及正义感十足的个性，某一天不小心撞破了学生会会长真木夏绪（赤崎千夏 配音）的秘密。这个长得漂亮、头脑聪明的会长“藤姬大人”，不仅是老师的得力助手，还是众人憧憬的对象，实际上她却在学生会室里日以继夜地进行“恋爱研究”！因为被真木拜托，莉子当上了学生会会长助理，每天和真木进行恋爱研究与实践。个性过于害羞经常躲起来、因此成为妖精般的存在的学生会书记棚桥铃音（水濑祈 配音）也加入了她们。 学生会原会长榎本结子（佐仓绫音 配音）和原会计水嶋沙依理（大地叶 配音）化解了与真木她们的矛盾后，也加入了“恋爱研究所”。五名个性迥异的少女，就此展开了恋爱研究活动！
天上掉下美少女的故事已经落伍了，今次是美少女破土而出！ 高中生御厨仁用古树的木材雕刻了精灵像木雕，本打算以此参加地区展览会。不想搬运中，木雕掉在地上，竟然突然变出一位蓝发美少女！ 这是怎么回事？漫画中美少女出现，住进主角家的荒唐剧情难道要发生在仁身上了吗？正当仁因这突如其来的变化而不知所措之际，少女开口说道：“吾乃产土神也。” 这位叫做薙的少女自称是神灵显灵，手拿动画片中的魔法棒去消灭“秽”。但是无论怎么看，薙不过是个爱耍大小姐脾气的可爱女孩。 仁，面对这位破土而出的少女，到底该怎么办？
