小新今年5岁了，不要以为他是那种懵懂无知的小孩，他其实人小鬼大，喜欢漂亮的姐姐，收养了一条棉花糖一样的流浪狗——小白，还经常讲些无厘头的黄色笑话。小新的妈妈美伢是一个全职主妇，粗心而又有点神经质的她经常被小新捉弄得七窍生烟，爸爸野原亦经常被这两母子搞得晕头转向。 《蜡笔小新》的作者以一个5岁小童的眼光，40岁的成年人的心态去观察这个大千世界，看到了许多光怪陆离的景象，小新一家的幽默故事亦由此产生。
本作以星际旅行的科幻背景，讲述能够使用「以太齿轮」操纵重力的少年「四季」、没什么人气的实况主「蕾贝卡」，以及机械蓝猫「哈比」。他们将乘坐战列舰「EDNES ZERO」四处冒险，寻找能够实现一切愿望的神秘生命体「MOTHER」。
故事发生在名为鹿缟的城市中。因为同暗恋的女生神泉安菜（堀江由衣 配音）告白被拒绝，平凡的少年大佛弹（植田佳奈 配音）决定前往鹿缟山换换心情。没想到，这居然成为了改变大佛弹一生的一趟旅途。目击到外星飞船坠毁地球的场面的大佛弹成为了事故的牺牲者，为了挽救无辜，事件的始作俑者宇宙仁（藤原启治 配音）重塑了弹的身体。可是，恶趣味的仁擅自将弹的性别和外形转换成了女性！从此，弹将以女性的身份重新开始高中的学习。 塞翁失马焉知非福，变成女性的弹却意外的吸引了安菜的注意。不仅于此，就连亲梅竹马来栖泊（田村由加利 配音）也向弹发起了积极的进攻，一时间，曾经默默无闻的弹成为了热门人物。弹的真实身份会暴露吗？这三人间又将发展处怎样的关系呢？女生之间的感情，还是真是难以捉摸啊。
